Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cml5Q9QXS8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cml5Q9QXS8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cml5Q9QXS8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cml5Q9QXS8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cml5Q9QXS8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cml5Q9QXS8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cml5Q9QXS8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cml5Q9QXS8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cml5Q9QXS8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cml5Q9QXS8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cml5Q9QXS8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cml5Q9QXS8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cml5Q9QXS8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cml5Q9QXS8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cml5Q9QXS8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms