Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rad18Q9QXK2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rad18Q9QXK2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms