Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim44Q9QXA7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms