Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms