Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms