Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc2lQ9JME7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms