Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gkap1Q9JMB0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gkap1Q9JMB0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms