Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col5a3Q9JLI2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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