Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms