Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

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Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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SacsQ9JLC8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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SacsQ9JLC8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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SacsQ9JLC8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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SacsQ9JLC8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
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SacsQ9JLC8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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SacsQ9JLC8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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SacsQ9JLC8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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SacsQ9JLC8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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SacsQ9JLC8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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SacsQ9JLC8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SacsQ9JLC8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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