Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nectin3Q9JLB9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nectin3Q9JLB9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nectin3Q9JLB9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nectin3Q9JLB9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nectin3Q9JLB9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nectin3Q9JLB9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nectin3Q9JLB9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nectin3Q9JLB9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nectin3Q9JLB9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nectin3Q9JLB9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nectin3Q9JLB9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nectin3Q9JLB9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nectin3Q9JLB9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nectin3Q9JLB9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nectin3Q9JLB9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nectin3Q9JLB9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nectin3Q9JLB9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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