Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms