Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Tmod2Q9JKK7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Tmod2Q9JKK7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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Tmod2Q9JKK7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Tmod2Q9JKK7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Tmod2Q9JKK7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Tmod2Q9JKK7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Tmod2Q9JKK7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms