Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx6Q9JKK1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms