Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp39a1Q9JKJ9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms