Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms