Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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