Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efcc1Q9JJF6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms