Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms