Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIC3

Dclre1a, DNA cross-link repair 1A protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1aQ9JIC3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dclre1aQ9JIC3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1aQ9JIC3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms