Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MkksQ9JI70 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms