Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3bQ9JHJ5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms