Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trim39Q9ESN2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trim39Q9ESN2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim39Q9ESN2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim39Q9ESN2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim39Q9ESN2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim39Q9ESN2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim39Q9ESN2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim39Q9ESN2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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