Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtofQ9ESF1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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