Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DysfQ9ESD7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms