Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ms4a4bQ9ES61 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ms4a4bQ9ES61 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ms4a4bQ9ES61 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ms4a4bQ9ES61 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a4bQ9ES61 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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