Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER41

Tor1b, Torsin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1bQ9ER41 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tor1bQ9ER41 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tor1bQ9ER41 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms