Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms