Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms