Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne8Q9DC53 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms