Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk1dQ9DC28 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms