Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms