Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Swt1Q9DBQ9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Swt1Q9DBQ9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms