Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrpraQ9DBG7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms