Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smdt1Q9DB10 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smdt1Q9DB10 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Smdt1Q9DB10 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Smdt1Q9DB10 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smdt1Q9DB10 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smdt1Q9DB10 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smdt1Q9DB10 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smdt1Q9DB10 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smdt1Q9DB10 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smdt1Q9DB10 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Smdt1Q9DB10 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smdt1Q9DB10 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Smdt1Q9DB10 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smdt1Q9DB10 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smdt1Q9DB10 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smdt1Q9DB10 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smdt1Q9DB10 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smdt1Q9DB10 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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