Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmbim4Q9DA39 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms