Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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