Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp12Q9D9M2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms