Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc70Q9D9B0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms