Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms