Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl4Q9D8E6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.6 ms