Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmigd1Q9D7L8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms