Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chmp4cQ9D7F7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms