Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce1Q9D720 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce1Q9D720 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce1Q9D720 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce1Q9D720 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce1Q9D720 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce1Q9D720 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce1Q9D720 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nsmce1Q9D720 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nsmce1Q9D720 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms