Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Nop56Q9D6Z1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Nop56Q9D6Z1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Nop56Q9D6Z1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Nop56Q9D6Z1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nop56Q9D6Z1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nop56Q9D6Z1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nop56Q9D6Z1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nop56Q9D6Z1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nop56Q9D6Z1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Nop56Q9D6Z1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop56Q9D6Z1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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