Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms