Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Necab3Q9D6J4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms