Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930449I24RikQ9D5E3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930449I24RikQ9D5E3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930449I24RikQ9D5E3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930449I24RikQ9D5E3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930449I24RikQ9D5E3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
4930449I24RikQ9D5E3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
4930449I24RikQ9D5E3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms