Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a3Q9D554 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms