Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Odf2lQ9D478 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Odf2lQ9D478 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Odf2lQ9D478 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf2lQ9D478 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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